脈動阻尼器的工作原理是遵循波義爾定律：即在恒定溫度下一定量的氣體的**壓力與體積成反比。P1×V1=P2×V2

脈動阻尼器內裝有彈性隔膜。隔膜將上部內腔中的壓縮氣體和下部外腔中的被輸送流體隔開。當計量泵進入排出行程，液體被壓入管路，使得管路壓力不斷升高，當此壓力超過脈動阻尼器的預充壓力，隔膜被物料頂著向上運動，部分液體將會進入阻尼器。直到隔膜兩側壓力平衡。

當泵排出行程結束，管路壓力下降，阻尼器內氣體腔中的壓力大于管路的壓力，于是，隔膜被氣體壓回其原始的位置，并將物料壓回管路中。

在泵的每個循環沖程中，計量泵與脈動阻尼器產生兩個脈沖波，并進行疊加。脈動阻尼器起到了“消峰填谷”作用，從而有效地消除了被輸送流體的脈動。